Untuk mewujudkan visi, misi, tujuan sasaran strategi dan mengacu pada Program Mahkamah Agung RI, Pengadilan Militer I-07 Balikpapan memiliki Program yang akan dilaksanakan yaitu:

1. Program Penegakan dan Pelayanan Hukum

Program Penegakan dan Pelayanan Hukum ditujukan untuk menjalankan pelaksanaan tugas dan fungsi utama Pengadilan Militer I-07 Balikpapan yaitu menerima, memeriksa, mengadili dan menyelesaikan perkara dilingkungan Pengadilan Militer I-07 balikpapan dengan Tujuan Strategis sebagai berikut:

1. Pencari keadilan merasa kebutuhan dan kepuasannya terpenuhi

Meningkatnya efektifitas pengelolaan penyelesaian perkara untuk mewujudkan kepercayaan publik atas layanan peradilan.

2. Setiap pencari keadilan dapat menjangkau badan peradilan untuk mencari keadilan

Selesai penyelesaian perkara secara sederhana, transparan, cepat biaya ringan dan akuntabel dilingkungan Pengadilan Militer I-07 Balikpapan.

Tujuan Strategis ini merupakan turunan dari 3 (tiga) sasaran strategis antara lain:

1. Terwujudnya proses peradilan yang pasti, transparan dan akuntabel.
2. Peningkatan efektifitas pengelolaan penyelesaian perkara.
3. Meningkatnya akses peradilan bagi masyarakat miskin dan terpinggirkan.